Protagonista della storia è un giovane come tanti di nome Hajime Tsukiyoda, la cui normale vita quotidiana crolla quando dei pesci rossi divora uomini appaiono nel quartiere di Shibuya. I pesci rossi sono ovunque: nel famoso incrocio, intorno alla statua di Hachiko e percorrono il quartiere uccidendo tutti gli esseri umani che incontrano.